Неузаконенная перепланировка может быть двух видов - подлежащая указаниванию или не подлежащая гос.регистрации, т.е. выполненная с грубыми нарушениями (перенос мокрох зон и т.п.).
Если перепланировка не подлежит узаканиванию в принципе - то вопрос приобретения такой квартиры - это выбор покупателя (может скидкой в вену продавец убедит, или уж очень квартира понравилась, что на это готовы закрыть глаза, или не связываться с таким вариантов - это человеческий фактор и личное дело каждого). Естественно ни о какой ипотеке под такой объект речи быть не может.
Если перепланировка подлежит узаканиванию, но еще не узаконена (кстати, работы с несущими стенами не всегда являются нарушающими закон), то рисков здесь намного меньше, под такую квартиру наше агентство ( ranad.ru) даже ипотеку может одобрить (банки одобрят такую квартиру, если в отчете оценщика будет написано, что неузаконенная перепланировка есть, но она подлежит узаканиванию) и сможем подобрать страховую, которая оформит по такой квартире ипотечное страхование.
И здесь снова будет 2 варианта: либо узаконивать такую перепланировку, либо нет. Если узаконивать, то подавая документы, естественно, не нужно в регистрирующем органе говорить, что перепланировка уже сделана, нужно обратиться к ним за разрешением для будущей перепланировки, а уж после получения такого разрешения, через некоторое время обратиться за узакониваем уже сделанной перепланировки.