Как правило, если в доме нет техэтажа (а это как раз старые пятиэтажки и т.п., в новых домах он есть почти всегда), то последний этаж стоит дешевле. Потому что многие покупатели боятся, что крыша будет протекать, например. Опять же, это относится к старым домам.
Ну а в новостройках обычно - чем выше, тем дороже.